石棉绒鼠是刘少英等2018年发表的新种，模式产地位于四川石棉县。线粒体基因组构建的系统发育树中，石棉绒鼠和克钦绒鼠构成姊妹群，基于简化基因组构建的系统发育树中，石棉绒鼠则位于指名亚属的中部。独立种地位在线粒体和简化基因组中均得到强烈支持。

石棉绒鼠是个体中等的绒鼠。成体体长平均约100mm（85-111mm），尾长平均42mm（30-46mm），后足长平均约17mm（16-20mm），耳高12mm（10-13mm）。尾长为体长的42%，短于体长之半。颜色和其他绒鼠类基本一致，整个背面毛色毛基灰黑色，毛尖灰色至黄棕色。腹面毛色灰黑色。背腹毛色没有明显界限。腭骨后缘截然中断，呈一横骨板，不与翼骨形成纵脊，没有翼骨窝。牙齿和大绒鼠（<Eothenomysmiletus>）基本一致，第1下臼齿左右三角形呈横的汇合，相互贯通；第1上臼齿内侧4个角突，外侧3个角突；第3上臼齿内侧4-5个角突，外侧3-4个角突。石棉绒鼠和其他绒鼠的主要区别是个体大小及尾长和体长的比例。石棉绒鼠个体小于同亚属（指名亚属：<Eothenomys>）的丽江绒鼠（<Eothenomys fidelis>）、克钦绒鼠（<Eothenomyscachinus>）和大绒鼠，大于黑腹绒鼠（<Eothenomys melanogaster>）、云南绒鼠（Eothenomyseleusis）和福建绒鼠（<Eothenomyscolurnus>）。尾长和体长的比例则小于克钦绒鼠、云南绒鼠和大绒鼠，但大于黑腹绒鼠、丽江绒鼠和福建绒鼠。