根田鼠很耐湿，在非常潮湿，甚至稍微涨水就被淹没的河谷湿地种群数量都很大。对草地、湿地生态系统有一定危害。在分类上，长期和柴达木根田鼠（<Microtus limnophilus>）混淆。单从头骨、牙齿特征看，它们确实很相似：第1下臼齿也只有4个封闭三角形，上臼齿列中3枚牙齿的形态也完全一致。但它们也有明显的区别：根田鼠个体大得多（柴达木根田鼠体长平均不达110mm），柴达木根田鼠尾长和体长之比仅35%左右，颜色也有很大区别。另外，就是分布区不重叠，柴达木根田鼠仅分布于青藏高原及其周围，而根田鼠在我国仅分布于新疆。

根田鼠筑洞穴居，洞道较简单，大多为单一洞口。筑窝于草堆、草根、树根之下方。个别个体筑有外窝。以植物的绿色部分为食，冬季挖食植物之根部、块茎幼芽、种子。营昼夜活动之生活方式。天敌主要为鼬类、狐和狼，猛禽类。

该物种列入《世界自然保护联盟》（IUCN）2013年濒危物种红色名录ver3.1—-易危（VU）。

在田鼠中属于体型较大的种类。成体体长平均约130mm（110-150mm）。尾较长，平均约55mm，超过体长的1/3（平均约42%），但不到体长的一半（个别个体超过体长一半）。后足长平均约20m。颅全长平均约28mm。尾上下两色。背面灰黑色。腹面白色。身体背面灰色到棕灰色，腹面毛色较浅，灰白色到淡黄白色。背面和腹面毛色界限不明显。腭骨为典型的田鼠型，两翼骨窝明显。第1下臼齿有4个封闭三角形。

国内仅分布于新疆。国外分布于欧洲、亚洲北部直到北美洲。

该种在新疆主要分布于北疆的天山山脉山地。针叶林、高山灌丛和草地、湿地均有分布。