赤颊黄鼠为松鼠科、黄鼠属的动物。栖息于低山草原、山前丘陵草原和半荒漠平原，有些地方可沿河谷上升至海拔1500米中山带的山地草原。

赤颊黄鼠是白昼活动的鼠类。其听觉、视觉和嗅觉都很灵敏，警惕性高。出洞前，在洞口四处了望，观察动静，如遇可疑之物或危险信号，立即发出短促单一的“吱”声。通报同类后，迅速逃入洞中。天气变化对其活动有一定的影响，一般无风、晴天和气温高时，活动频繁，在地面活动的时间有时可达220分钟。当遇到阴雨天气，则活动减弱，甚至出现由低处向高处移动的现象。在7级以上大风时，很少出洞活动。5月中旬上午8时至下午6时前活动频繁，尤其在午间12-14时，有一次活动高峰，早晚活动甚少，夜间无活动。活动范围一般不超过30米，但有时可达40米以上。

赤颊黄鼠的出入蛰时期与当地的温度有关。一般多在3月中、下旬出蛰，9月末开始进入冬眠。在夏季气温较高，植物提早枯黄的地区，可能存在夏蛰现象。其进入夏蛰的时间，大约从7月初幼鼠分居之后开始，一直过渡到冬眠。

赤颊黄鼠的洞穴，多散布在丘岗的阳坡坡脚、沟谷和小溪两岸。洞口直径约5厘米。居住洞之洞道总长3-5米，分支不多，有窝巢，洞口多为一个。临时洞短浅，无巢，亦无分支。幼鼠分居时，常将临时洞改建为居住洞。冬眠洞较深，冬眠巢多在2米以下，入蛰时将冬眠洞的一段洞道封堵，以利安全越冬。

赤颊黄鼠喜食植物的绿色部分、花果、块根及少量鞘翅目昆虫。在农作区亦取食麦类、豆类及苜蓿的幼嫩茎、叶。早春时多以枯草的根茎为食，秋季亦食少量种籽。

赤颊黄鼠全年仅繁殖一次，经过冬眠的鼠，从3月底出蛰，出蛰后很快进入交配期。交配期的雌雄鼠频繁窜洞，极为活跃。赤颊黄鼠平时单居独室，但在此时经常可于一个洞中。交配期由4月上旬起持续到4月底，约3周左右，此时，可以同时见到妊娠鼠、生殖道内有阴道塞的鼠和处于排卵期的鼠，其两性比例基本上为1:1；不育鼠约为全部雌鼠的10%。种群的交配一妊娠期（内蒙古大约从4月中、下旬到5月底）约50多天，而妊娠期则为28-30天。产仔期上要集中在5月上旬到月底。6月上旬全部孕鼠产完，所时4周。产仔数为2-10只，最常见是4-7只。孕鼠于分娩后在子宫内所留下的子宫斑于入蛰前消退殆尽。幼鼠与母鼠分居的时间一般集中在6月下旬，但最早出窝活动的幼鼠可能在6月初。

在我国，赤颊黄鼠种群数量波动属于比较稳定的类型，年度间变化不大，仅在不同生境内有差别。