甘肃仓鼠的分类地位争议较大，有的学者将甘肃仓鼠作为独立属独立种，有的学者作为大仓鼠属（<Tscherskia>）的独立种；有的学者作为大仓鼠（<Tscherskia triton>）的亚种。最新的分类学著作（Wilson et al. 2016）作为独立属独立种。所以，其最终分类地位有待深入研究。

列入《世界自然保护联盟》（IUCN）2013年濒危物种红色名录ver3.1—-低危（LC）。

甘肃仓鼠是个体较大的仓鼠，接近大仓鼠。体长平均 135mm 左右，尾长平均大于100mm。尾长比例大于大仓鼠。尾上覆盖长的毛，整个尾颜色为一致的灰色，尾端灰黑色，尾端的毛形成毛束。而大仓鼠尾毛短密，尾端或多或少呈白色，这是两者 外形上的主要区别。甘肃仓鼠的耳灰黑色，前后足灰白色。腹面毛基灰色，毛尖灰白色，背腹之间毛色没有明显的界限。头骨上，眶上脊明显，吻部相对较长，高冠齿。

甘肃南部和四川北部。栖息地为灌丛、阔叶林。