澜沧江姬鼠属于鼠亚科（Murinae）。该种分类地位争议较大，长期以来将其作为龙姬鼠（<Apodemus draco>）的亚种，因为形态上和龙姬鼠很近似，仅背部毛色有差异，从外形上确实很难将它们分开。近年来，通过分子系统学方法才最终将澜沧江姬鼠独立为种。它和龙姬鼠分布区域不重叠。澜沧江姬鼠没有亚种分化。栖息于林区、灌丛及靠近山区的灌木杂草丛中，喜潮湿地带，筑洞穴居生活，以多种植物种子、果实为食，也吃植物绿色部分及一些昆虫。主要在夜间与晨昏活动，繁殖期为4-11月，每胎产仔最少3仔，最多10仔，平均5-7仔。

牙齿形态和龙姬鼠近似，第3上臼齿舌侧有3个角突。毛较长，被毛颜色黄褐色，后背有一个明显的黑色区域。有些个体整个背面中央均有黑色区；尾长于体长，约为体长的110%。耳大，18mm左右，耳缘黑色，或者整个耳前面均为黑色，毛很短。耳背也是黑色，毛短。额部通常为灰黑色。背腹之间的界限明显。腹部毛基灰色，毛尖灰白色。尾上下二色，背面灰黑色，腹面灰白色。大约50%个体尾端有毛束。前后足背面均为纯白色。爪乳白色，前后足均为5指，爪上密生银白色长毛。性乳头1-2=6。

分布于中国西部三江并流区域，包括高黎贡山、梅里雪山、白马雪山，以及西藏南部的工布地区。国外分布于缅甸及印度北部。