短耳沙鼠属于沙鼠亚科（Gerbillinae）。该属只有一个种，仅分布于中国。种级分类单元地位稳定，有3个亚种。是荒漠生态系统中的重要成员，但数量不大，对其研究较少，生态学习性知之甚少。
短耳沙鼠穴居，洞形简单。多数为一个洞口，很少2~3个洞口。洞口直径约40~45mm。洞道长2~3m，洞深0.5~1m，有盲支。洞口旁常有小土堆，洞穴分散，不成群。
短耳沙鼠由于栖息范围狭窄，活动资料所知甚少，但与其他沙鼠不同，其与大沙鼠、子午沙鼠等混居，生活在相互连通的洞穴里，或洞穴离得很近，因此并不排除群体的存在、也许是因为在这样形成了稳定的配对关系，甚至还出现了一些家庭结构。
短耳沙鼠主要取食植物的绿色部分和种子，也取食些昆虫。主要的天敌有狐、鼬及各种猛禽。
短耳沙鼠繁殖开始于4月，每年2胎，每胎3~7只。幼崽生下来没有毛而且眼睛是闭着的，不能自我调节身体的温度，在2周内，它们完全依赖母沙鼠的看护和照料。只有那些在生育季节早期出生的幼沙鼠才能在同一个季节里发育成熟并孕育下一代（大约出生后2个月），出生晚一点的幼沙鼠6个月后才发育成熟，并在下一个季节繁殖。
短耳沙鼠种群分布不连续，数量少，数量趋势未知。在其分布的地段，密度均远远低于子午沙鼠或其他鼠类。在野外捕鼠中，只占13%~15%。
列入《世界自然保护联盟》（IUCN） 2008年濒危物种红色名录ver 3.1——无危（LC）。
