柴达木根田鼠筑洞穴居，洞道较简单，大多为单一洞口。筑窝于草堆、草根、树根之下方。个别个体筑有外窝。以植物的绿色部分为食，冬季挖食植物之根部、块茎幼芽、种子。营昼夜活动之生活方式。天敌主要为鼬类、狐和狼，猛禽类。

根田鼠于夏秋之间进行繁殖。年繁殖3-4次，在祁连山地，于7、8月间捕到的成年雌鼠，多数为怀孕个体。每胎通常有3-9仔，平均为5仔。

该种是鼠疫病毒的携带者。

列入《世界自然保护联盟》（IUCN）2008年濒危物种红色名录ver3.1——无危（LC）。

个体在田鼠属种为中等。体长平均100mm（80-117mm）。尾长平均38mm(34-48mm),约为体长的35%。耳较短，平均13mm（12-15mm），略微露出毛外。体背颜色褐色，或者灰褐色。腹部毛色灰白色。尾颜色较深，黑褐色，尾腹面较淡。其鉴定特征主要在牙齿上：第1下臼齿只有4个封闭三角形（和根田鼠一样），这一点和很多其他种类的田鼠不一样，其他种类田鼠大多数有5个封闭三角形；第3上臼齿内侧有4个角突，外侧有3个角突。

为中国特有种。分布于青海和四川、甘肃、陕西、宁夏等省（区）部分区域。

栖息海拔2000米以下的亚高山灌丛，林间隙地，草甸草原、山地草原、沼泽草原等比较潮湿，多水的生境。农田、苗圃绿洲中亦有少量分布。