黑线仓鼠属于仓鼠亚科（Cricetinae）。该物种分类地位稳定，但亚种比较混乱，在我国就多达6个，是否都成立，有待深入研究。是我国北方干旱和半干旱区域的常见种，也出现于该区域的农田生态系统中。驯服后和其他仓鼠种类没有太大区别，可当作宠物。

黑线仓鼠为夜行鼠类，除秋季储粮季节，白天一般不出洞活动。黎明前、黄昏后活动频繁，一般以19~21时活动最为频繁。夏、秋季节在遇阴雨来临之前，黑线仓鼠提前出洞觅食，捕获率比正常高。黑线仓鼠以颊囊搬运食物入洞，其活动距离一般不超过200米，巢区范围多在22.5亩以内，最大不超过75亩，雌鼠的活动范围小于雄鼠。黑线仓鼠夏季也储存少量麦粒等，秋季储粮分散于多个储藏室。

主要吃农作物种子。解剖32只黑线仓鼠颊囊，主要是黄豆、绿豆、小麦、花生及草籽、甲虫，以农作物种子为主，出现频率占100%，而草籽出现频率为15.6%，甲虫类出现频率仅占3.1%。而董谦等（1966）报道，旅大地区黑线仓鼠颊囊中草籽出现频率占65.35%，农作物种子仅占25.99%。而王岐山（1962）解剖11只合肥地区的鼠胃；其中有山芋、面粉、豆饼、麦粒、菜籽、糠粒等，说明有部份个体在冬季迁入住宅，以人的食物为食，并有喜食油料作物的倾向。以上说明黑线仓鼠由于地区和环境的不同，食物成分亦有所改变。

黑线仓鼠洞穴多建筑在干燥的农田、田埂、坟地、荒地等处，每个洞系有2~3个洞口，洞口直径多在2.5~3厘米左右，洞口光而圆，洞口无盗出的粪土。洞口入洞后垂直向下约10~15厘米，然后斜行向下。洞道全长约2~3米。洞内有仓库1~2个，还有窝室。仓库内存粮多为0.5~1公斤。窝室为碗状，直径多在10×10厘米，窝室距地面深多在0.5~1米。赵肯堂等（1979）报道的内蒙古黑线仓鼠窝室最深可达距地面2.5米左右，这可能与气温有关。

黑线仓鼠无冬眠现象。一般在8周龄时性成熟，最适应繁殖年龄是12周龄。发情周期是3~7天（平均4.5天）。发情周期可分为发情前期、发情期、发情后期和间休期。发情前期持续半天左右，阴门粘膜呈粉红色或红色，湿润而松弛，易拔开，此期雌、雄鼠愿意接近，雌鼠往往围绕着雄鼠转。发情期阴门进一步充血，呈暗红色，阴蒂呈深红色或紫红色，此期雌鼠活动频率，常常翘尾，很容易交配。雌鼠发情期一般出现在黄昏，如果人工控制光照，变黑暗后2~3小时即可发情。发情后期雌鼠的阴门和阴蒂充血、肿胀很快消失，雌鼠不再翘尾，雌、雄经常发生咬架。间休期阴道口略微开口或封闭，阴门变枯燥、苍白，此期雌鼠变得很凶。黄昏至晚10时进行交配受孕率高。

黑线仓鼠的妊娠期为20~21天，平均20天14小时。哺乳期21天。产仔雌雄比例为47.4：52.6。初生仔鼠重1.5~2.5克，成年鼠达30~40克，初生仔数无毛、闭眼，3~4日龄长被毛。7日龄全身蒙上被毛，10~14日龄睁眼、有听觉。1月龄雄鼠睾丸从腹腔降至阴囊。黑线仓鼠寿命为2~2.5年。

黑线仓鼠表现出明显的季节性繁殖特征，春、夏季繁殖，冬季停止。每年3~4月和8~9月出现两个繁殖高峰。每年繁殖3~5胎，每胎平均4~9只幼仔，但以6只居多。第一次繁殖高峰产的鼠大部分当年参与繁殖，后期出生的鼠越冬后才参与繁殖。

黑线仓鼠系农业主要害鼠。每只鼠一年可以损耗粮食约2kg。繁殖能力极强，并有大量贮藏粮食的习性，因之被它们糟蹋的粮食极多，有时也盗食播人土壤中的种子，咬食禾苗。对农作物害处极大。黑线仓鼠还是流行性肝炎及蜱传性斑疹伤寒病原体的自然传播者，20世纪40年代初于中国内蒙古首次自黑线仓鼠中检出鼠疫菌。又相继在吉林、河北等地多处的黑线仓鼠中发现可自然感染鼠疫。

该物种列入《世界自然保护联盟》（IUCN）2013年濒危物种红色名录ver3.1—-易危（VU）。

已被入列中国国家林业局2000年8月1日发布的《国家保护的有益的或者有重要经济、科学研究价值的陆生野生动物名录》。

在仓鼠中个体中等，有颊囊（用于储藏实物）。体长平均100mm左右（80-110mm），尾长短于30mm（平均22mm），但长于后足（平均17mm）。最显著的特征是背中央有一条明显的黑线，足底没有稠密的毛（坎氏毛足鼠背面也有一条黑线，但坎氏毛足鼠足底毛稠密，且尾长在14mm以下，短于后足长）。耳灰黑色，有白边。牙齿上，第1上臼齿由两纵列和三横嵴组成；第2上臼齿由两纵列两横嵴组成；第3上臼齿长径和短径差不多。

国内在北方分布较广，包括东北三省、内蒙古、山西、陕西、河北、河南、山东、安徽、天津、北京、宁夏、甘肃等。国外分布于俄罗斯、蒙古、朝鲜半岛。

黑线仓鼠主要栖息在野外，其洞穴多建在高出水面的田埂、沟沿和垅背上。栖息环境十分广泛，尤喜栖息在沙质土壤中。遍及草原、山地、平原农田、疏林等都有，主要将洞穴造在沟渠，路旁，田埂，井台，土坡，坟堆等地势较高的干燥环境。一般不迁入农家，多活动于耕地内和路旁、荒滩地等处。