小五趾跳鼠属于五趾跳鼠亚科（Allactaginae）。跳鼠类分布于北非、阿拉伯及亚洲北部的沙漠及荒漠地带，是这种极端环境中为数不多的哺乳动物。小五趾跳鼠种级分类地位稳定，没有争议，亚种较多，但中国仅1个亚种——准噶尔亚种（<A. elater dzungariae>）。

小五趾跳鼠主要栖息于蒿草、针茅荒漠草原、芨芨草及梭梭植物丰富的半荒草原。以多种植物的枝叶、根茎、外皮为食。

耳大，向前翻超过鼻端。后足是前足的3倍，但通常不超过65mm。身体背面深灰到暗灰色，侧面棕黄色；冬季毛色较浅，背面灰黄白色，侧面灰白色。腹面从颏部到尾根为纯白色。尾长，略超过体长的1.5倍，平均160mm。尾端多毛膨大呈毛笔状，尾梢部为白色，其余膨大部分为黑色，但沿中间有一条白色的线。尾是跳跃时的平衡器。后足5趾，中间3趾在趾两侧有较硬的刚毛。

国内分布于新疆北部。国外分布于伊朗、俄罗斯。

主要栖息于蒿草、针茅荒漠草原、芨芨草及梭梭植物丰富的半荒草原。