长尾鼠耳蝠的模式产地在福建。由 Allen（1923）依据福建标本命名，之后Ognev（1927）依据尾长略超过体长特征命名西伯利亚东部的标本为<M. longicaudatus>，Ellerman & Morrison-Scott (1951)等将后者列为长尾鼠耳蝠的一个亚种。

长尾鼠耳蝠在飞行状态下发出的回声定位叫声为短调频型．叫声包括3个谐波，其中第1谐波最强且出现于所有的叫声中，频率起始于110．8 kHz，结束于 50．2 kHz，持续 3．5ms．第 2，3谐波较弱，分别出现于 50．0%和 25．0%的叫声中，调频范围为138．4～ 116．6和 193．6－170．8 kHz．根据回声定位叫声的特点，推断长尾鼠耳蝠是在复杂环境中捕食地面昆虫。

体较较小，前臂长36-43mm。耳较短，前折不达吻端，耳屏宽短，约为耳长的一半。胫骨长达17-20mm，约为后足长的2 倍。尾等于或略超过体长，翼膜起于外趾的基部。背毛长而蓬松，毛基暗褐，毛尖浅沙黄色带光泽；腹毛较背毛短，毛基3/4 黑褐色，毛尖浅褐色。翼、股间膜颜色较背毛颜色略深。胫部及股间膜背腹面无毛，股间膜毛孔排列成平行的“V”字形。头骨的吻鼻部略向上翘，矢状嵴和人字嵴均不太明显；吻鼻背中央有浅的纵沟，吻侧面略显浅凹。

国内分布于黑龙江、吉林、四川、福建等。国外分布于俄罗斯、韩国、日本。

长尾鼠耳蝠一般栖息于山地、竹林以及岩洞。