马来鳄外形看起来与恒河鳄（Gavialis gangeticus）非常相似，但其头部会逐渐往口鼻部缩窄，而且也没有雄性恒河鳄吻端的球状突起。
历史上马来鳄的分布范围较广，几百年前还曾出现于中国南方。以往专家多认为其属于鳄亚科，而与真正的恒河鳄关系较远，不过后来也有些学者认为马来鳄可能的确和恒河鳄有一定的关系，应属于食鱼鳄亚科。
这是一种跟大熊猫一样稀有的鳄鱼，曾经和扬子鳄一样在我国南方也有大量分布，但是由于明清时期的“小冰期”影响，东亚气温骤降，马来鳄无法适应中国寒冷的冬天，便在中国灭绝了，扬子鳄则以其强大的耐寒能力幸存了下来。
由于马来鳄的生存环境要求有特定的漂浮植物丛和成荫的水边栖息地，故一段时期以来不断的砍伐森林、修筑水坝、开辟新水道、非法捕猎，已使其栖息地大量丧失。由于对马来鳄的数量并不确定，暂被定为极危种或濒危种。
列入《世界自然保护联盟濒危物种红色名录》（IUCN 2011年 ver 3.1）——易危（VU）。
列入《濒危野生动植物种国际贸易公约》（CITES）——附录Ⅰ。
在泰国的养殖场和美国的布朗克斯动物园、迈阿密动物园能成功繁殖。
保护野生动物，杜绝野味。
维护生态平衡，人人有责！
