猫儿山小鲵生活于海拔1978～2015米较高山区的沼泽地及其周围地带，其附近植被以南方铁杉和山顶矮林为主。喜食小型无脊椎水生生物较多，比如蚯蚓和石娥幼体。猫儿山小鲵遇到灯光、声音和拨水等干扰时会迅速选择覆盖物或者腐殖质泥土作为藏身地。

猫儿山小鲵仅在3个静水坑内繁殖，雌鲵将卵袋产在水质清澈透明、水底淤泥较厚的静水坑内，水坑水深20～50厘米。2005年11月中旬的一个中午，该鲵产了卵，此时水温7℃左右。该鲵繁殖季节较长，从11月初至翌年2月，一尾雌鲵产卵胶袋一对，卵袋长度不超过200毫米，呈弧形；1条卵袋内有卵41粒左右（37～45，n=4），雌鲵产卵后即离开产卵场，而雄鲵仍滞留在产卵场内护卵。该鲵仅繁殖期进入水塘内配对产卵；其他季节营陆栖生活，很难寻其踪迹，当地群众在锄地时偶尔见到。

猫儿山小鲵受到的威胁主要来自人为活动干扰，不同区域受到的威胁各不一样。在繁殖区主要受修建酒楼和开发旅游景点的影响。路面硬化、大量建筑垃圾和排放到湖里的碱性建筑废水直接影响了它们的生境。频繁的人类活动也使得施工现场周边的植被环境遭到严重践踏，一定范围内影响了猫儿山小鲵的栖息地环境。

列入《中国国家重点保护野生动物名录》一级。