长舌果蝠其舌甚长，舌尖具刷状突起，舌面中央有三尖形乳突（tridentate papillae）、前臂长47.31～51.01 mm 与长舌果蝠（Eonycteris spelaea）相似，但第二指具爪，翼膜止于第三趾趾基，上唇前缘无沟槽，鼻孔不突出，尾极短、隐于毛被中；头骨后部明显向后下方倾斜，齿槽后延线明显超过人字嵴上缘达及顶间骨上缘水平，牙齿非常长而细弱，与长舌果蝠明显有别，这些特征与印度东北部和东南亚一带的安氏长舌果蝠（Macroglossus sobrinus）一致。

Corbet & Hill（1992）将长舌果蝠分为3亚种：（1）指名亚种 <E. s. spelaea>，分布于中南半岛；（2）苏拉威西亚种 <E. s. rosenbergii>，体色较暗，上颌第三枚臼齿小或缺失，只分布于印度尼西亚苏拉威西；（3）菲律宾亚种 <E. s. glandifera>，体型较大，吻部不太尖细，分布于菲律宾到爪哇。我国的长舌果蝠为指名亚种 <E. s. spelaea>。集大群栖息于洞穴中，黄昏时在森林和果园附近觅食。食物包括花粉和花蜜，为传粉蝙蝠。